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| TMX3 | Q96JJ7 | AL691447.3-201 | ENST00000635020 | 330 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | DEFB130B-201 | ENST00000437818 | 240 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC099799.1-201 | ENST00000439809 | 192 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC00393-201 | ENST00000443621 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | AL139260.1-202 | ENST00000456813 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC093523.1-201 | ENST00000503268 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | LINC02164-201 | ENST00000566684 | 272 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | MIR4444-2-201 | ENST00000584390 | 74 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC009318.2-201 | ENST00000610917 | 651 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | HMGB1P24-202 | ENST00000615653 | 685 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC007485.1-201 | ENST00000616755 | 206 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC241585.2-209 | ENST00000638217 | 143 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ZNF404-202 | ENST00000587539 | 1851 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | CENPE-201 | ENST00000265148 | 8612 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | USP15-203 | ENST00000353364 | 14950 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNY1P16-201 | ENST00000363063 | 111 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC00862-202 | ENST00000367356 | 759 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNRPG-202 | ENST00000413456 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC083867.1-201 | ENST00000413567 | 457 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC010731.2-201 | ENST00000415275 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC074117.2-201 | ENST00000417130 | 397 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | NUP35P1-201 | ENST00000422734 | 947 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MRPS18CP6-201 | ENST00000423587 | 223 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC243964.1-201 | ENST00000441814 | 261 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL020998.1-201 | ENST00000444923 | 229 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNRPG-205 | ENST00000449935 | 428 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | GSTA11P-201 | ENST00000452866 | 669 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SPAG11B-206 | ENST00000458665 | 444 nt | TSL 5 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RPL27AP5-201 | ENST00000469428 | 449 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MED28P2-201 | ENST00000475771 | 317 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RN7SL297P-201 | ENST00000483161 | 293 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC02494-201 | ENST00000509824 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC096711.1-201 | ENST00000510967 | 347 nt | TSL 5 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AP002884.4-201 | ENST00000527589 | 594 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC007536.1-201 | ENST00000533382 | 349 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC009163.5-201 | ENST00000575421 | 637 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR4474-201 | ENST00000579189 | 78 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | NPPA-AS1_3.1-201 | ENST00000617059 | 108 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | HOTTIP_4.1-201 | ENST00000618195 | 165 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | DDX60L-207 | ENST00000505890 | 4568 nt | TSL 2 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | CLUL1-208 | ENST00000581619 | 2449 nt | TSL 2 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MYOT-201 | ENST00000239926 | 2337 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AK9-201 | ENST00000285397 | 2566 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ZNF334-205 | ENST00000615481 | 3706 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-858P-201 | ENST00000362436 | 107 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.145-201 | ENST00000363527 | 102 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.577-201 | ENST00000384794 | 101 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC01344-201 | ENST00000420760 | 261 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC091153.2-202 | ENST00000441700 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RN7SL807P-201 | ENST00000470923 | 297 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |