Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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