Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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