Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDK4Q16654 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms