Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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