Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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SNAPC1Q16533 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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SNAPC1Q16533 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNAPC1Q16533 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNAPC1Q16533 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNAPC1Q16533 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNAPC1Q16533 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNAPC1Q16533 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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