Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms