Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms