Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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