Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SHHQ15465 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHHQ15465 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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