Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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PTPRKQ15262 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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