Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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