Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CAPRIN1Q14444 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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