Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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