Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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GTF2H2Q13888 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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GTF2H2Q13888 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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GTF2H2Q13888 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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GTF2H2Q13888 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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GTF2H2Q13888 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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GTF2H2Q13888 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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GTF2H2Q13888 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
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