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| RUNX3 | Q13761 | FAM206BP-201 | ENST00000510179 | 541 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAC1P5-201 | ENST00000512182 | 576 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-189P-201 | ENST00000516120 | 101 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP40-201 | ENST00000517211 | 242 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC118273.2-201 | ENST00000532092 | 465 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006199.1-201 | ENST00000548728 | 219 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LCORL-202 | ENST00000382224 | 4984 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHD1-201 | ENST00000284049 | 6457 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | OR5AK2-201 | ENST00000326855 | 996 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1252P-201 | ENST00000363054 | 104 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | 5S_rRNA.2-201 | ENST00000391293 | 112 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | CDKN3-212 | ENST00000620759 | 196 nt | TSL 5 BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC009033.1-201 | ENST00000624279 | 431 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4C15-202 | ENST00000642128 | 951 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003984.1-201 | ENST00000450977 | 4104 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC121333.1-201 | ENST00000567488 | 2709 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF72P-201 | ENST00000425869 | 1908 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX9-207 | ENST00000560582 | 2005 nt | TSL 3 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLCO1B3-201 | ENST00000261196 | 2840 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP44-203 | ENST00000426172 | 3037 nt | TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138393.1-203 | ENST00000327086 | 343 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-105P-201 | ENST00000363470 | 161 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA72.1-201 | ENST00000363485 | 129 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SNORA25.6-201 | ENST00000364121 | 118 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-750P-201 | ENST00000390946 | 107 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MORN2-203 | ENST00000409131 | 544 nt | TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MCF2-204 | ENST00000414978 | 3813 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDCL2P1-201 | ENST00000419302 | 352 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LINC02041-201 | ENST00000440726 | 246 nt | TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL353572.1-201 | ENST00000442490 | 417 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P23-201 | ENST00000456759 | 269 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | HMGN1P12-201 | ENST00000499125 | 195 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MIR5692C1-201 | ENST00000585309 | 91 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087045.1-201 | ENST00000605856 | 382 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATG5-207 | ENST00000613993 | 733 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353997.5-201 | ENST00000618886 | 171 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009248.2-201 | ENST00000619826 | 254 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092794.2-201 | ENST00000620933 | 563 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CACNB4-228 | ENST00000636598 | 7808 nt | TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEL1L2-201 | ENST00000284951 | 2224 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VPS54-202 | ENST00000354504 | 3594 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPAG11A-202 | ENST00000326625 | 445 nt | TSL 5 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA32.2-201 | ENST00000384049 | 122 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR627-201 | ENST00000384979 | 97 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR767-201 | ENST00000390228 | 109 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL589987.2-201 | ENST00000417426 | 582 nt | TSL 2 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P111-201 | ENST00000418453 | 477 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093911.1-201 | ENST00000419129 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000705.1-201 | ENST00000454567 | 350 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |