Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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