Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
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