Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CBX3Q13185 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CBX3Q13185 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CBX3Q13185 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CBX3Q13185 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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