Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.4 ms