Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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