Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHAF1AQ13111 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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