Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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TRAF1Q13077 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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TRAF1Q13077 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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TRAF1Q13077 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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TRAF1Q13077 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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TRAF1Q13077 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAF1Q13077 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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