Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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