Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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