Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXI1Q12951 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.4 ms