Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
BPTFQ12830 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
BPTFQ12830 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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