Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms