Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms