Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3AP98173 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms