Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms