Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
TRERF1Q96PN7 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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TRERF1Q96PN7 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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TRERF1Q96PN7 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRERF1Q96PN7 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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