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| TMX3 | Q96JJ7 | MTND4P19-201 | ENST00000446659 | 478 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | FOXP2-211 | ENST00000408937 | 6443 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ADAM3A-203 | ENST00000461344 | 2157 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | FAM214A-204 | ENST00000546305 | 3697 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | DLEU2_6.3-201 | ENST00000340052 | 136 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | CASP1-201 | ENST00000353247 | 423 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MT-ND1-201 | ENST00000361390 | 956 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.496-201 | ENST00000384444 | 101 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-264P-201 | ENST00000517134 | 104 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | DLEU2_6.2-201 | ENST00000620994 | 136 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC006111.3-201 | ENST00000622137 | 383 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR6733-201 | ENST00000635723 | 61 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | GCNT4-201 | ENST00000322348 | 5554 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | TFEC-202 | ENST00000320239 | 6605 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | TLK1-206 | ENST00000434911 | 2156 nt | TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | PRKACB-207 | ENST00000394838 | 4294 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-527P-201 | ENST00000363425 | 104 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORA71.1-201 | ENST00000364523 | 117 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORA9.2-201 | ENST00000365361 | 133 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORD116-20-201 | ENST00000384529 | 92 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORD88.1-201 | ENST00000408684 | 91 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-1077P-201 | ENST00000410506 | 102 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AP000275.1-201 | ENST00000411943 | 390 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC01870-201 | ENST00000427042 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC124916.1-201 | ENST00000444020 | 547 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | NIPA2P5-201 | ENST00000452282 | 464 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU7-23P-201 | ENST00000459465 | 62 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC091179.1-201 | ENST00000461606 | 579 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC103975.1-201 | ENST00000482506 | 483 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC068781.1-201 | ENST00000488231 | 618 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC02110-201 | ENST00000503870 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC116655.1-201 | ENST00000508324 | 901 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC010420.1-201 | ENST00000515077 | 509 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORA31.1-201 | ENST00000515993 | 133 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORA31.5-201 | ENST00000516190 | 133 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-581P-201 | ENST00000516214 | 105 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AP000889.1-201 | ENST00000530968 | 660 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |