Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP43Q70EL4 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP43Q70EL4 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP43Q70EL4 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP43Q70EL4 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP43Q70EL4 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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