Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CFAP47Q6ZTR5 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CFAP47Q6ZTR5 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms