Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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GEN1Q17RS7 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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GEN1Q17RS7 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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GEN1Q17RS7 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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GEN1Q17RS7 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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GEN1Q17RS7 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GEN1Q17RS7 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
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GEN1Q17RS7 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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GEN1Q17RS7 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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GEN1Q17RS7 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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