Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFE2Q16621 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms