Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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