Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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