Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSX1Q16384 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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