Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CNGA3Q16281 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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