Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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SS18Q15532 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SS18Q15532 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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