Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHHQ15465 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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