Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
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