Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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GBX1Q14549 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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GBX1Q14549 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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GBX1Q14549 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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GBX1Q14549 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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