Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTCH1Q13635 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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