Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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TCOF1Q13428 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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TCOF1Q13428 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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TCOF1Q13428 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TCOF1Q13428 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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