Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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SGCGQ13326 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SGCGQ13326 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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