Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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