Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms